夫婦とも「要支援」ですが、住宅改修給付は40万円使えますか？

使えます。ただし、ひとつの工事に重複して使うことはできません。例えばご主人の分は手すりに、奥様の分は便器取替えにといった具合にしてください。
※お住まいの自治体により、判断が異なる場合があります。詳しくは市区町村の担当課までお問合せください。